Управление Лицеем осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.

Единоличным исполнительным органом Лицея является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью Лицея.

Директор Лицея назначается Территориальным управлением по согласованию с Департаментом на основании трудового договора.

В Лицее сформированы коллегиальные органы управления:

• Совет Лицея,
• Общее собрание работников Лицея,
• Педагогический совет,
• Совет родителей,
• Совет учащихся старших классов.

Компетенция, порядок формирования состава коллегиальных органов управления, срок их действия определы уставом Лицея.

Структурных подразделений в лицее нет.